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生物種の名前や遺伝子配列を自然言語で入力するだけで、枝長やブートストラップ値を含む論文発表レベルの進化系統樹図を数秒で生成。特別なソフトウェアは不要、アカウント登録も不要、完全無料。

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Live sample · CI/CD pipeline — type above to make your own
CI/CD Pipeline — Flowchart Flowchart with 13 nodes and 15 edges. CI/CD Pipeline A → B B → C C → D D → E: no no E → A D → F: yes yes F → G G → H H → I: no no I → E H → J: yes yes J → K K → L: no no L → E K → M: yes yes CI Passes? CI Passes? Build Image Build Image Deploy Staging Deploy Staging Stage OK? Stage OK? Rollback Staging Rollback Staging Deploy Prod Deploy Prod Canary OK? Canary OK? Rollback Prod Rollback Prod Released Released Notify Author Notify Author Dev Push Dev Push Lint Lint Unit Tests Unit Tests

4ステップで系統樹を作成する方法

  1. 分類群や配列を記述する

    対象となる生物種や遺伝子配列の名前を説明文として入力します。既知の関係やアウトグループ、枝長やブートストラップ値の有無も指定可能です。

  2. 系統樹を生成する

    「生成」ボタンをクリックすると、AIがNewick形式の系統樹を解析し、枝長とブートストラップ値が注釈された視覚的な系統樹図を表示します。

  3. トポロジーを確認する

    系統樹の分岐順序(トポロジー)が既知の進化関係と合致しているか確認します。アウトグループが正しく根に配置され、期待するクレードが含まれているかチェックします。

  4. 論文や教育用にエクスポート

    生成された系統樹は画像としてダウンロードでき、論文やプレゼンテーション、教材にすぐに利用できます。アカウント不要で、生成からエクスポートまで完結します。

系統樹(系統発生樹)とは

Frequently asked questions

系統樹とクラドグラムの違いは何ですか?

クラドグラムは進化的関係の分岐パターン(トポロジー)のみを示し、枝の長さは同じに描かれます。一方、系統樹(フィログラム)は枝長に進化的変化量(サイトあたりの置換数)や時間(百万年)を反映します。両者は同じトポロジーを持つことが多いですが、系統樹のほうがより定量的な情報を提供します。

ブートストラップ支持率とは何ですか?

ブートストラップ支持率は、系統樹の各枝に対する信頼性を統計的に示す値です。アライメントデータを何度もリサンプリング(通常1000回)して、同じ枝が出現する頻度を求めます。100%はその枝がすべての反復で出現したこと(非常に高い支持)を意味し、70%未満は支持が弱いと見なされます。通常、内部ノードに表示されます。

系統樹におけるアウトグループとは何ですか?

アウトグループは、注目するグループ(イングループ)よりも遠縁であることが既知の分類群です。アウトグループを系統樹に加えることで、樹に根を付けることができます。根はアウトグループとイングループを分ける枝に置かれます。例えば、大型類人猿の研究では、テナガザルや旧世界ザルがアウトグループとしてよく使われます。

言語族のような生物以外のデータにも使えますか?

はい、使えます。系統樹は歴史言語学で言語が共通祖先から分岐する過程を示すのに用いられ、文化進化の研究など、共通祖先からの階層的分岐をモデル化できるあらゆる分野で利用されています。対象のエンティティと既知の関係を記述すれば、ツールが適切な系統樹構造を生成します。

Newick形式とは何ですか?

Newick形式は、系統樹をテキストで表現する標準的な方法です。入れ子の括弧でクレードをグループ化し、分類群名を列挙し、枝長はコロンで続けて記述し、最後にセミコロンで終えます。例えば、((Human:0.01, Chimpanzee:0.01):0.02, Gorilla:0.03); は3つの分類群からなる簡単な系統樹を表します。